BIOPROFILING en quelques mots

La plateforme de BioProfiling a vu le jour grâce au soutien financier de l’Union européenne et de la Wallonie dans le cadre de la programmation FEDER-FSE 2014-2020. Ce projet, associant des équipes de l’UMONS et de l’ULB, fait partie du portefeuille Wallonia Biomed qui s’articule autour de 4 axes forts : l’imagerie, l’immunologie, les échantillons biologiques humains et le BioProfiling. C’est dans cette optique que s’inscrit ce projet financé à hauteur de 3,4 millions d’euros pour l’acquisition d’équipements de pointe dédiés à l’identification et la quantification de marqueurs biologiques. En savoir plus

META-VISION and MS-QUANTA

La plateforme de BioProfiling se compose de deux plateaux technologiques parfaitement complémentaires : un plateau « Méta-Vision » dédié aux petites molécules et un plateau « MSQuanta», commun avec l’ULiège, dédié quant à lui aux macromolécules (protéines). Elle est localisée à l’UMONS reconnue pour son know-how en spectroscopie de type RMN (Résonance Magnétique Nucléaire) et en spectrométrie de masse et qui dispose déjà d’une masse critique importante de chercheurs et d’instruments dans ce domaine. Elle est ouverte à tous les acteurs du secteur des biotechnologies à savoir les universités, les centres de recherche, les hôpitaux et les entreprises.

META-VISION

Le plateau « Méta-Vision » se base sur la technologie RMN et sera dédié à la métabolomique. Cette approche novatrice permet d’analyser l’ensemble des petites molécules (MW < à 1500 Da) présentes, par exemple, dans une cellule, un organe ou un fluide biologique à un temps donné et dans des conditions données afin d’identifier une signature métabolique caractéristique. L’étude de maladies ou d’effets toxiques causés par des substances chimiques ou des candidats médicaments est alors basée sur les intensités relatives de chacune des composantes de la signature. Une identification structurale de molécules potentiellement intéressantes pourra être réalisée par RMN 1D et 2D.

Equipment

  • Spectrometer RMN, 600 MHz Bruker AVANCE™

Applications

  • Analyse métabonomique (NMR-based) dans les fluides corporels ou dans les tissus (RMN HR-MAS)
  • Identification structurale de molécules organiques par RMN multi-noyaux 1 D et 2D
  • Etude des mécanismes associés à des événements toxiques et pathologiques
  • Identification de signatures métaboliques caractéristiques d’une maladie
  • Développement de méthodes alternatives pour tester l’efficacité et/ou la toxicité de composés chimiques, de candidats médicaments.

MS-QUANTA

Le plateau MS-Quanta, se base sur la spectrométrie de masse pour l’identification et la quantification absolue de molécules plus massives comme les protéines. Ce plateau repose sur une technologie de protéomique ciblée type SRM/MRM et d’acquisition indépendante des données (DIA). Ces deux approches permettent de quantifier plus de 100 cibles en une analyse et permettent d’éviter les écueils des approches immunologiques liés à l’utilisation d’anticorps. La particularité et l’atout du plateau MS-Quanta est de posséder deux unités complémentaires et parfaitement coordonnées (plateau multi-sites), localisées l’une dans la plateforme BioProfiling (UMONS/ULB – Portefeuille WALLONIA BIOMED) et la seconde au sein de la plateforme GIGAProteomics (ULiège – Portefeuille BIOMED HUB). Cette structure « bicéphale » permet en outre de satisfaire les exigences imposées dans le cadre de la validation de candidats biomarqueurs, à savoir :

  • Méthodologie indépendante de l’instrumentation
  • Haut débit (large cohorte)
  • Etudes multi-sites

Accès et offres

La plateforme Bioprofiling met à disposition une infrastructure et des services de développement pour la recherche et l’enseignement en protéomique, en métabolomique et en spectrométrie de masse à différents niveaux : Recherche collaborative, Collaboration industrielle, Formations et Enseignement.
Prestations techniques
  • Accès aux plateformes technologiques
  • Etudes de faisabilité
  • Transfert de connaissances et de technologie
  • Formation R&D pour les entreprises
  • Recherche contractuelle
  • Appels à projets nationaux et internationaux
  • Thèses
  • Stages
Nous fournissons des prestations tarifées aux clients externes. Contactez-nous au début de votre projet. Si vous êtes intéressés par le projet Bioprofiling et particulièrement par la protéomique et la métabolomique, contactez dans un premier temps les Prof. R. Wattiez, Prof. JM Collet or Dr. B.

Contact

BIOPROFILING

Prof. Ruddy Wattiez

Email : Ruddy Wattiez

Phone : +32 (0) 65 37 33 12

METAVISION

Metabolomics : Prof. J.M Colet
Structural aspects : Prof. Sophie Laurent

METAVISION

Dr. Baptiste Leroy